Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ftsj3Q9DBE9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ftsj3Q9DBE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.9 ms