Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph9Q9D9V4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph9Q9D9V4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph9Q9D9V4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph9Q9D9V4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms