Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actrt1Q9D9J3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actrt1Q9D9J3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms