Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco5aQ9D9D5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms