Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D727 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D727 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D727 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D727 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D727 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D727 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D727 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D727 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D727 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D727 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D727 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D727 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D727 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D727 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D727 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D727 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D727 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D727 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D727 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D727 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D727 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D727 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D727 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D727 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D727 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D727 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D727 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D727 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D727 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D727 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D727 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms