Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cmtm5Q9D6G9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtm5Q9D6G9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtm5Q9D6G9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms