Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Obox1Q9D350 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Obox1Q9D350 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox1Q9D350 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms