Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal2bQ9D1Y9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms