Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl53Q9D1H8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1947.8 ms