Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pbdc1Q9D0B6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbdc1Q9D0B6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms