Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx7Q9CY18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx7Q9CY18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx7Q9CY18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms