Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr3kQ9CQZ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms