Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl35Q9CQL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl35Q9CQL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mrpl35Q9CQL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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