Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQF4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQF4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQF4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQF4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms