Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Med4Q9CQA5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Med4Q9CQA5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Med4Q9CQA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms