Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc5Q9CQA1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc5Q9CQA1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc5Q9CQA1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc5Q9CQA1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc5Q9CQA1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc5Q9CQA1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc5Q9CQA1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms