Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ska1Q9CPV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ska1Q9CPV1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska1Q9CPV1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms