Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930550L24RikQ99PA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930550L24RikQ99PA7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms