Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel1Q99MW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel1Q99MW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel1Q99MW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms