Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp3Q99JB6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp3Q99JB6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms