Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrbp1Q99J45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nrbp1Q99J45 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbp1Q99J45 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms