Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp4Q921I6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp4Q921I6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms