Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Grin3bQ91ZU9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Grin3bQ91ZU9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Grin3bQ91ZU9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Grin3bQ91ZU9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,7 ms