Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx15Q91WE1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx15Q91WE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms