Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI4

Carf, Calcium-responsive transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CarfQ8VHI4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CarfQ8VHI4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CarfQ8VHI4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CarfQ8VHI4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CarfQ8VHI4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms