Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx7Q8VDS3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms