Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1Q8VDF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1Q8VDF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1Q8VDF2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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