Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc9Q8VC31 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc9Q8VC31 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc9Q8VC31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.5 ms