Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms