Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxn4Q8K3Q3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn4Q8K3Q3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms