Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matr3Q8K310 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Matr3Q8K310 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matr3Q8K310 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms