Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil3Q8K203 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil3Q8K203 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms