Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rftn2Q8CHX7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rftn2Q8CHX7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms