Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm9955Q8CEJ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm9955Q8CEJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9955Q8CEJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm9955Q8CEJ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm9955Q8CEJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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