Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Atg16l1Q8C0J2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l1Q8C0J2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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