Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp5Q8BX09 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms