Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp38Q8BW70 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp38Q8BW70 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp38Q8BW70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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