Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip4Q8BQP8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip4Q8BQP8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip4Q8BQP8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms