Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem260Q8BMD6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem260Q8BMD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms