Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy1Q8BIJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy1Q8BIJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy1Q8BIJ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms