Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D130040H23RikQ8BII3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
D130040H23RikQ8BII3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms