Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmd3Q8BHD4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmd3Q8BHD4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd3Q8BHD4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms