Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU5

Ccny, Cyclin-Y, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnyQ8BGU5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnyQ8BGU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnyQ8BGU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnyQ8BGU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnyQ8BGU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnyQ8BGU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CcnyQ8BGU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnyQ8BGU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnyQ8BGU5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms