Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4cQ811C2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4cQ811C2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms