Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc172Q810N9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc172Q810N9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc172Q810N9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms