Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rab3gap1Q80UJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rab3gap1Q80UJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab3gap1Q80UJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms