Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdccag8Q80UF4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sdccag8Q80UF4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms