Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ClmQ7TSN2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClmQ7TSN2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmQ7TSN2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms