Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Znf516Q7TSH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf516Q7TSH3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf516Q7TSH3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms