Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1cQ7TSF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1cQ7TSF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms